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基于基因測(cè)序魚(yú)露發(fā)酵橘青霉YL-1鑒定及安全性評(píng)價(jià)
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 368 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 宋佳佳,古汶玉,林昌浩,張曉勇,甘忠宏,謝莉,高向陽(yáng)
關(guān)鍵詞: 橘青霉YL-1|真菌毒素|安全性|基因測(cè)序
摘要:

目的:為彌補(bǔ)傳統(tǒng)方法在檢測(cè)菌株產(chǎn)毒素上的不足,用基因組方法分析橘青霉YL-1(Penicillium citrinum YL-1,P. citrinum YL-1)物質(zhì)生物合成途徑及關(guān)鍵基因,以此評(píng)價(jià)P. citrinum YL-1在魚(yú)露發(fā)酵生產(chǎn)過(guò)程中的安全性。方法:應(yīng)用ITS基因測(cè)序鑒定菌株,利用Illumina平臺(tái)Hiseq測(cè)序技術(shù)對(duì)菌株YL-1進(jìn)行基因組survey測(cè)序,通過(guò)生物信息分析產(chǎn)青霉毒素、黃曲霉毒素及典型絲狀真菌毒素的非核糖體多肽合成代謝、聚合酮酶代謝、聚合酮酶-非核糖體多肽聯(lián)合代謝、萜類(lèi)化合物代謝和氨基酸相關(guān)代謝途徑及基因,考察菌株YL-1產(chǎn)真菌毒素能力,判斷其是否存在產(chǎn)真菌毒素的潛在危害。結(jié)果:ITS鑒定菌株YL-1與P. citrinum同源性99%,survey測(cè)序結(jié)果表明P. citrinum YL-1全基因組大小為31.92?Mb,GC為46.27%。利用Maker2基因預(yù)測(cè)技術(shù)得到預(yù)測(cè)基因11?980?個(gè)。其中,被KOG注釋基因5?417?個(gè),被COG注釋基因4?946?個(gè);比對(duì)KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)被注釋通路323?條,注釋基因3?525?個(gè)。代謝分析表明,注釋到可能產(chǎn)真菌毒素相關(guān)的代謝途徑有5?條,僅注釋到1?種產(chǎn)黃曲霉毒素代謝途徑的同源基因Afld及其他5?種相關(guān)基因,但并未注釋到其完整代謝途徑。結(jié)論:ITS基因測(cè)序鑒定菌株YL-1為P. citrinum,P. citrinum YL-1基因注釋存在1 種產(chǎn)黃曲霉毒素的同源基因及其他5?種相關(guān)基因,雖不存在完整代謝鏈,但P. citrinum YL-1運(yùn)用于魚(yú)露及相關(guān)產(chǎn)品的發(fā)酵安全性仍值得進(jìn)一步考察。

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