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基于全基因組測(cè)序解析貝萊斯芽孢桿菌產(chǎn)胞外多糖的分子基礎(chǔ)
來源:導(dǎo)入 閱讀量: 209 發(fā)表時(shí)間: 2024-11-08
作者: 梁悅琪, 張玉姣, 代藝偉, 陳映羲, 董亮, 張素芳
關(guān)鍵詞: 貝萊斯芽孢桿菌;全基因組測(cè)序;胞外多糖合成;基因
摘要:

本研究采用二代Illumina HiSeq與三代Pacbio平臺(tái)相結(jié)合的全基因組測(cè)序技術(shù),對(duì)分離自郫縣豆瓣的產(chǎn)胞外多糖菌株貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)L-39進(jìn)行全基因組測(cè)序。對(duì)B. velezensis L-39進(jìn)行完整的基因組裝、預(yù)測(cè)、注釋、次級(jí)代謝產(chǎn)物合成基因簇和關(guān)鍵基因功能分析,重點(diǎn)關(guān)注其碳水化合物代謝、核苷糖合成途徑以及胞外多糖生物合成基因簇。結(jié)果顯示,B. velezensis L-39全基因組大小為3 970 591 bp,共編碼3 770 個(gè)基因。通過京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫進(jìn)行途徑分析,在基因組中預(yù)測(cè)出一條eps基因簇和32 個(gè)功能基因,繪制出一條完整的胞外多糖合成通路。在此基礎(chǔ)上對(duì)關(guān)鍵基因進(jìn)行了聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增驗(yàn)證,結(jié)果與預(yù)期相符。本研究旨在發(fā)掘與該菌株胞外多糖合成密切相關(guān)的基因,為深入解析其胞外多糖產(chǎn)生的分子基礎(chǔ)和實(shí)際應(yīng)用開發(fā)提供科學(xué)依據(jù)。

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